纳帕海自然保护区位于香格里拉县城西北8公里处。纳帕海是一个高原湖泊，海拔3266米。有许多珍奇飞禽栖息于此，其中最有名的要数国家一类保护动物黑颈鹤，每年9月到翌年的3月，可以看到大量的飞鸟在水面上盘旋翔集。
纳帕海自然保护区是香格里拉最有高原特色的风景区之一，这里气候湿润，每年5月草原已是绿草茵茵。6月伊始，各种野花竞相开放，牛羊成群。西面的石卡、叶卡、辛苦雅拉三大雪山俏然挺立。雪山、草原、牛羊组成了大西南的塞北风光。秋冬来临，草原一片金黄，远处的雪峰倒映于湖泊中，黑颈鹤、黄鸭、班头雁云集于此，在草丛中、水面上嬉戏漫游，使广阔空灵的草原另具一番诗情画意。
纳帕海保护区地势平坦，三面环山，冬春季节，山岭积雪。那曲河、奶子河等十余条河弯弯曲曲，流经草源注入纳帕海 。海西北面的辛苦雅拉雪女山麓有天然落水洞九处 ，洪水经过溶洞，从尼西汤满河排出、流入金沙江。每逢雨季湖面增高，到旱季洪水排出湖面缩小，大部分地区成为沼泽和草甸。纳帕海西北山上有古寺衮钦寺的遗址。该寺建于明末，毁于清初。明代旅游家徐霞客曾慕名前往参观，被丽江木氏土司所阻拦未能如愿而抱憾不已。登临古寺遗址 ，纳帕草原尽收眼底 ，在清幽、宁静的自然风光中凭吊古迹，别有一番风情。
特别提醒：纳帕海是高原季节性湖沼，夏季，湖面增大、水深；秋冬湖水下落。