航空
敦煌机场位于敦煌市东13公里处，现开通有敦煌至兰州、西安、北京、嘉峪关、乌鲁木齐等城市的固定航线，每周38个班次。从机场到市区，可乘坐出租车，费用在30～40元之间。
铁路
敦煌现有两个火车站，分别是柳园站和敦煌市火车站。
柳园站在敦煌市西北方向128公里处，可直达上海、北京西、西安、成都、兰州，乌鲁木齐等数十个城市。从柳园站到敦煌市区，不分昼夜都有汽车，中巴15元，2个小时；出租车40元左右，1个小时。
敦煌市火车站，在敦煌市东10公里处，乘大巴公交车3路即可到达市区。敦煌铁路连接敦煌与瓜州县柳沟站，全长169公里，设小宛、瓜州、甜水井、敦煌市4个车站，最高时速为120公里。从嘉峪关到敦煌全程400多公里，列车（7527/7528次）从当日6:30从嘉峪关始发，下午13:11到达，行驶约7小时。
此外还有西安－敦煌（K591/K592次），兰州－敦煌（N857/N858）的列车可抵敦煌车站。
公路
客运可通往酒泉、兰州、西安、哈密、吐鲁番、乌鲁木齐、格尔木等城市。如去西藏，可到格尔木再转车前往拉萨。敦煌市内除去
玉门关仍为戈壁沙路外，都有笔直宽阔的柏油马路通往其它景点。
敦煌汽车站在鸣山路飞天宾馆对面，每日有车发往兰州、鸣沙山月牙泉、南湖(阳关)、嘉峪关等地，敦煌到嘉峪关约需7～8小时。