航空
牡丹江海浪机场是军民合用机场，位于牡丹江市西南隅，经机场路与鹤大公路相接，距市中心9公里。先后开通了牡丹江至哈尔滨、沈阳、大连、延吉、北京、上海、广州、天津、烟台、青岛、长春、俄罗斯海参崴等12个国内外城市的定期和包机航线。
继牡丹江至俄罗斯雅库斯克国际航线开通后，牡丹江机场又开通了牡丹江至俄罗斯哈巴罗夫斯克航线。迄今，牡丹江共开通三条俄罗斯航线，分别通往海参崴、雅库斯克和哈巴罗夫斯克。另外，韩国大韩航空有限公司开通了牡丹江到仁川的航班，每周六执行，航班号为KE9823/4，机型是波音737－900。
目前，从牡丹江市区内到飞机场还没有公交车和机场巴士，只能打车前往，从牡丹江火车站到飞机场大约25元左右。
铁路
牡丹江火车站，是特等站，位于黑龙江省东南部，牡丹江市区内，是滨绥线、图佳线铁路干线的交会点。
游客前往牡丹江市，大多游览镜泊湖，从哈尔滨乘子弹头高速火车，到牡丹江仅需四个半小时，再转乘两个半小时公共汽车即到景区中心——镜泊山庄。在镜泊湖游览2天足够了。
从吉林长白山方向来的游客，可乘早班车到敦化，转敦化往东京城方向的班车在杏山站下车，再转中巴到达镜泊湖边，全程约7个半小时。
从吉林图们方向来的游客，可乘火车去东京城，4个小时即可到达，再转乘中巴1小时就能到镜泊湖了。
公路
牡丹江市的客运交通十分便捷发达，已初步形成了以201、301国道为主骨架，以县乡公路为支线，连接“六城”，辐射主要乡镇，沟通“两湖”、“两岸”和经济富线、旅游热线的公路网络。牡丹江地区共有公路客运站7个，客运分站16个。位于西三条路与平安街交叉口处的客运总站和火车北站广场，每天都有开往各县（市）、主要景区景点的客车，价格在几元至几十元不等。