航空
台北每日有复兴、中华、远东等航空公司的班机直达台南机场，一张机票约新台币1300-1500元。
铁路
高铁台南站位于台南县归仁乡沙仑地区，与市中心直线距离约10公里，服务范围涵盖台南县市与高雄县北部部分市乡镇地区。
透过新辟之高铁大道(桥下道路，目前施工中)、国道1号、台86东西向快速公路台南－关庙线、省道台1、台19甲、县道177、182、乡道南149等重要道路交通系统，乘客可以快速转往台南地区所有重要城镇。
台南—新竹，约70分钟；台南—台中，约43分钟；台南—台北，约103分钟。
| 方向（往） |
路線名稱/起迄 |
停靠
月台 |
客運公司 |
主要停靠站/(行經道路) |
|
台南科學園區 |
高鐵台南站－台南科學園區 |
3 |
興南客運 |
高鐵站-台南科學園區 |
| 高鐵台南站－奇美醫院 |
4 |
興南客運 |
高鐵站--仁德--永康-桂田中信-鹽行-奇美醫院 |
地址：台南县归仁乡归仁大道100号
营业时间 06：20～24：00
公路
高雄、台北有台汽国光号及统联客运，每隔30-60分钟有固定班次，台北到台南约新台币450元，高雄到台南约150元左右。