位于宫殿的最里面。这里是教皇的公用礼拜堂，也是教皇选举的会场。这里有绘画史上的巨作，被称为“绘画史上的神曲”的米开朗棋罗的《最后的审判》。

    这座礼拜堂是1473年由教皇西库斯托斯四世作为教皇圣庙修建的，当时由波提切利、基尔兰代奥、佩尔吉诺等绘制勒两侧的墙壁，后来根据朱利奥2世命令由米开朗棋罗绘制勒天花和剩下的壁画。据说出于他与朱利奥二世对艺术的执着以及在天花板上描绘的实际操作比较困难，他的膝盖都浮肿了，背也变得驼背了。到底不愧由这么一段来历，纳戏剧性的画面构成让游客叹服。

    墙上的壁画取《旧约·圣经》为题材，正面是《最后的审判》，右侧是《基督传》，左侧以《摩西传》为主题。天花板的中央是《旧约·圣经》的创世纪，而画有预言者、巫女的像。最精彩是《亚当诞生》、《原罪与流放乐园》、《诺亚方舟》。

    这里经过多年的修复(清洗)工作，米开朗棋罗花了6年时间作成的祭坛画《最后的审判》。戏剧性的画面构成将我们带到了一个瞑想的世界。中央是由玛丽亚和圣徒们随着的基督在下判决，右侧是被选中的人升天，左侧是罪恶深重的人下地域。基督脚边的巴尔特罗梅奥展示着人皮，那张皮上的奇异的脸据说是米开朗棋罗的自画像。当时这里有基督等几个人的裸体画像，由于成了丑闻，由庇奥四世命令达尼埃勒·勃鲁特拉加上了衣服。结果，当时一流画家也因此被后世称为“兜裆布画家”。